Apakah Mutasi Virus Corona Di Balik Pacu Kilat COVID-19 India?

Majalah New Scientist, jurnal ilmiah dan teknologi yang kredibel, mengatakan, mengutip proyek “ Nextstrain ”, proyek pelacakan patogen, bahwa virus Corona varian Inggris, atau B.1.1.7, bertanggung jawab atas wabah Virus Corona di Asia, Menyebabkan 40% kasus. Varian Afrika Selatan atau garis keturunan B.1.351 dari virus korona adalah yang berikutnya, bertanggung jawab atas 16% kasus.

Namun, India, yang sekarang mencatat kasus individu paling banyak setiap hari, menyatakan bahwa tidak ada bukti yang menunjukkan hal ini, bahkan jika negara itu memiliki mutasi virus korona buatan sendiri yang sekarang menjadi perhatian.

Pada 24 Maret, pemerintah Union mengonfirmasi bahwa strain virus korona ganda, atau B.1.617, sebagian besar terdapat di Maharashtra dan dalam jumlah kecil di enam negara bagian lainnya. Namun menurut catatan Kementerian Kesehatan terbaru, infeksi mutan telah menyebar ke tiga negara bagian lagi. Jadi metamorfosis hadir di banyak negara bagian yang terpukul keras oleh gelombang kedua, termasuk Maharashtra, Delhi, Benggala Barat, Gujarat, Karnataka, dan Madhya Pradesh dan setiap negara bagian melihat tren yang meningkat.

Laporan New Scientist mempertanyakan kinerja “ SARS-CoV-2 Consortium for Genomics (INSACOG) ” India yang didirikan pada Desember 2020 untuk menemukan rangkaian gen berbeda yang dapat lebih menular dan mematikan daripada jenis virus korona asli sebelumnya. Tahun. Ini juga meningkatkan kemungkinan seperti apakah strain mutan baru berada di belakang peningkatan pesat gelombang COVID dalam berbagai situasi.

Ambil Maharashtra, misalnya.

Antara Januari dan Maret tahun ini, Maharashtra melihat peningkatan jumlah mutasi ganda virus corona sebesar 15-20%. Pada 10 April, National Institute of Virology membagikan laporan tentang analisis sekuensing genom terbatas dari sampel positif yang mengatakan bahwa virus corona bermutasi ganda bertanggung jawab atas 61% kasus di Maharashtra. Hingga 220 sampel dari 361 sampel ternyata positif virus corona bermutasi ganda. Mumbai belum melaporkan jenis ini, tetapi itu bisa menjadi faktor besar berikutnya dalam gelombang kedua virus korona jika kita menganalisis sampel dalam skala yang lebih besar.

Cerita berlanjut

Strain B.1.617 berevolusi ketika dua strain yang bermutasi, E484Q dan L452R, digabungkan untuk membentuk silsilah ketiga. Strain E484Q dari India dan strain L452R California. Ini adalah jenis domestik yang sekarang ditemukan di banyak negara lain, termasuk Amerika Serikat dan Inggris. Fakta bahwa subspesies India sekarang ditemukan di banyak negara lain hanya menunjukkan bahwa mutasi ganda sedang menyebar.

Apa yang mungkin menjadi kesalahan terbesar di sini adalah kenyataan bahwa India belum menguji sampel untuk virus Corona dalam skala besar meskipun virus mutannya berada di luar skala mutasi yang cepat di banyak negara.

Dalam 128 hari, India hanya berhasil menyusun urutan genom dari sekitar 14.000 sampel uji untuk varian virus corona meskipun varian Inggris sekarang menjadi jenis COVID utama di balik 40% kasus di Asia. Menurut analisis Newstrain atau di beberapa negara, termasuk Inggris di mana 98% kasus baru disebabkan, atau di Amerika Serikat dengan 25-30% kasus baru karena varian Inggris, varian Afrika Selatan yang resisten terhadap beberapa vaksin, atau varian Brazil yang dapat menginfeksi orang lagi.

India, rata-rata, hanya menguji 109 sampel positif setiap hari untuk menganalisis genom virus korona guna mendeteksi mutasi mematikan lainnya dari virus tersebut, sementara sebenarnya pengurutan genom adalah cara terbaik untuk menemukan varian virus yang paling banyak menyebar. .

Global Influenza All Data Sharing Initiative (GISAID) adalah platform berbagi data pengurutan genom pada virus influenza dan virus COVID-19, India dan banyak negara lain menyediakan data pengurutan genom ke situs web gratis ini. Menurut basis data GISAID, Inggris sejauh ini menyediakan 3,67 lakh genom, diikuti oleh AS dengan 2,83 lakh genom, Jerman dengan lebih dari 54.000 genom, dan Denmark dengan lebih dari 50.000 genom, tetapi India, negara kedua yang paling terpengaruh tertinggal. di belakang sini. Sampai saat ini, negara hanya menyediakan 7.842 urutan genom.

Ya, kami tidak dapat mengatakan apakah mutasi virus korona sebagian besar berada di belakang peningkatan baru-baru ini, tetapi pada saat yang sama, kami juga tidak dapat menyangkal fakta bahwa B.1.617 telah muncul sebagai alasan utama di balik lonjakan COVID-19 di Maharashtra dalam studi yang dilakukan. sejauh ini.

Yang penting di sini adalah fakta bahwa kami belum menguji sekuensing genetik dalam skala besar untuk melihat seberapa luas penyebarannya bahkan jika kami mengidentifikasi varian virus corona ini pada 7 Desember tahun lalu. Mutan tersebut sudah berumur sekitar empat bulan tergantung pada tanggal penemuannya. Demikian pula, varian Inggris ditemukan pada 80% sampel uji dari Punjab yang diambil untuk pengurutan genom dan disebarkan ke sekitar 19 negara bagian di negara tersebut.

Dapat dikatakan bahwa sejumlah kecil sampel uji positif telah diurutkan secara genomik dan hasilnya tidak dapat direfleksikan dalam basis populasi yang lebih besar tetapi satu-satunya jalan keluar dari hal ini adalah dengan lebih banyak pengujian. Karena tidak melakukannya bisa menjadi kesalahan fatal jika kemudian kita menemukan bahwa virus yang bermutasi tersebut kebal terhadap vaksin seperti yang terjadi pada varian Afrika Selatan yang kebal terhadap Covishield, vaksin COVID utama India.

Baca semua file berita terbaru Dan Berita terbaru Sini